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63925ec0ba
commit
bcefb72a2d
GPG Key ID:
05D5D1107E5100A1
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@ -1,6 +1,6 @@
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import json
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from sys import argv
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from os import path, kill
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from sys import argv, exit
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from os import path
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from dataclasses import dataclass
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@ -13,17 +13,25 @@ class Location:
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def main():
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input_file = argv[1]
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||||
output_file = argv[2]
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alternate_mode = len(argv) == 4 and argv[3] == "alt"
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if not test_file(input_file):
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print("Input file does not exist")
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kill(1)
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exit(1)
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if test_file(output_file):
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print("Output file already exists")
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kill(1)
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exit(1)
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locations = read_input_csv_to_wells(input_file)
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json_obj = tubes_to_tubes_json(locations)
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if alternate_mode:
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with open(output_file, 'w') as file:
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for location in locations:
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index = (location.row - 1) * 12 + location.col
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file.write(f"{index}\n")
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exit(0)
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with open(output_file, 'w') as file:
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json.dump(json_obj, file)
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Binary file not shown.
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@ -0,0 +1,60 @@
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31
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93
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14
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96
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6
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2
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3
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1
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7
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66
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@ -0,0 +1,64 @@
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87
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93
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90
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14
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96
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6
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17
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3
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9
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23
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20
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12
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62
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76
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73
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79
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71
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82
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38
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36
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86
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47
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60
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95
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92
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16
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2
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13
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19
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5
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11
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61
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22
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8
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75
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81
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78
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84
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26
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37
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50
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35
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59
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88
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85
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91
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1
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94
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4
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15
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21
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7
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18
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24
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74
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10
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77
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83
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80
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@ -0,0 +1,60 @@
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31
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42
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49
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34
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87
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93
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90
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96
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14
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3
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23
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20
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76
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62
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73
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79
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65
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82
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38
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41
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33
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54
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30
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36
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86
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89
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95
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92
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16
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2
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13
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19
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61
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22
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75
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81
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78
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84
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26
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37
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29
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50
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35
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32
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53
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88
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85
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91
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1
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94
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4
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15
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21
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24
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74
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66
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77
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83
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80
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@ -0,0 +1,60 @@
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72
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25
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31
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42
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48
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49
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55
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87
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90
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14
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96
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6
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23
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9
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20
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12
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62
|
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76
|
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73
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79
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71
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38
|
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54
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30
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36
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86
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47
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60
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95
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89
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2
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13
|
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19
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11
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61
|
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22
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8
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75
|
||||
67
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78
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84
|
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26
|
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37
|
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43
|
||||
50
|
||||
35
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||||
59
|
||||
88
|
||||
85
|
||||
91
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1
|
||||
21
|
||||
7
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||||
18
|
||||
24
|
||||
74
|
||||
10
|
||||
66
|
||||
77
|
||||
83
|
||||
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|
@ -0,0 +1,98 @@
|
|||
import json
|
||||
from sys import argv
|
||||
from os import path, listdir
|
||||
from dataclasses import dataclass
|
||||
|
||||
|
||||
@dataclass(frozen=True)
|
||||
class Tube:
|
||||
barcode: str
|
||||
row: int
|
||||
col: int
|
||||
|
||||
|
||||
@dataclass(frozen=True)
|
||||
class LetterTube:
|
||||
barcode: str
|
||||
index: int
|
||||
group: int
|
||||
|
||||
|
||||
def main():
|
||||
# ARGV[1] Should be path to Ziath Output
|
||||
# ARGV[2] Should be path to Letter sequences
|
||||
# ARGV[3] Should be path to output
|
||||
# ARGV[4] Should be word
|
||||
|
||||
available_barcodes = argv[1]
|
||||
letter_dir = argv[2]
|
||||
output_path = argv[3]
|
||||
input = argv[4]
|
||||
|
||||
if not validate_word(input, letter_dir):
|
||||
print("Failed to validate word")
|
||||
exit(1)
|
||||
|
||||
available_tubes = read_available(available_barcodes)
|
||||
letters = []
|
||||
for letter in input:
|
||||
x = get_tubes_for_letter(letter,
|
||||
len(letters) + 1,
|
||||
available_tubes,
|
||||
letter_dir)
|
||||
available_tubes = available_tubes[len(x):]
|
||||
letters += x
|
||||
|
||||
output = letter_tubes_to_obj(letters)
|
||||
with open(output_path, 'w') as file:
|
||||
json.dump(output, file)
|
||||
|
||||
|
||||
def letter_tubes_to_obj(x: [LetterTube]) -> dict:
|
||||
output = {}
|
||||
output["Items"] = [{"BarcodeValue": y.barcode} for y in x]
|
||||
output["TargetPositions"] = [{"PositionIndex": y.index,
|
||||
"GroupIndex": y.group}
|
||||
for y in x]
|
||||
|
||||
return output
|
||||
|
||||
|
||||
def get_tubes_for_letter(letter: str,
|
||||
letter_index: int,
|
||||
available_tubes: [Tube],
|
||||
letter_dir: str) -> [LetterTube]:
|
||||
positions = get_letter_positions(letter, letter_dir)
|
||||
|
||||
if len(positions) > len(available_tubes):
|
||||
raise Exception("Insufficient tubes to fill order")
|
||||
|
||||
pixels = []
|
||||
for i, position in enumerate(positions):
|
||||
pixel = LetterTube(available_tubes[i],
|
||||
position,
|
||||
letter_index)
|
||||
pixels.append(pixel)
|
||||
return pixels
|
||||
|
||||
|
||||
def read_available(p: str) -> [str]:
|
||||
with open(p, 'r') as file:
|
||||
return [x.strip() for x in file.readlines()]
|
||||
|
||||
|
||||
def validate_word(input: str, letter_dir: str) -> bool:
|
||||
letters_available = [x[0] for x in listdir(letter_dir)]
|
||||
has_required_letters = all([x in letters_available for x in input])
|
||||
|
||||
return has_required_letters
|
||||
|
||||
|
||||
def get_letter_positions(letter: str, letter_dir: str) -> [int]:
|
||||
filename = [f for f in listdir(letter_dir) if f[0] == letter][0]
|
||||
with open(path.join(letter_dir, filename), 'r') as file:
|
||||
return [int(x.strip()) for x in file.readlines()]
|
||||
|
||||
|
||||
if __name__ == "__main__":
|
||||
main()
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,98 @@
|
|||
import json
|
||||
from sys import argv
|
||||
from os import path, listdir
|
||||
from dataclasses import dataclass
|
||||
|
||||
|
||||
@dataclass(frozen=True)
|
||||
class Tube:
|
||||
barcode: str
|
||||
row: int
|
||||
col: int
|
||||
|
||||
|
||||
@dataclass(frozen=True)
|
||||
class LetterTube:
|
||||
barcode: str
|
||||
index: int
|
||||
group: int
|
||||
|
||||
|
||||
def main():
|
||||
# ARGV[1] Should be path to Ziath Output
|
||||
# ARGV[2] Should be path to Letter sequences
|
||||
# ARGV[3] Should be path to output
|
||||
# ARGV[4] Should be word
|
||||
|
||||
available_barcodes = argv[1]
|
||||
letter_dir = argv[2]
|
||||
output_path = argv[3]
|
||||
input = argv[4]
|
||||
|
||||
if not validate_word(input, letter_dir):
|
||||
print("Failed to validate word")
|
||||
exit(1)
|
||||
|
||||
available_tubes = read_available(available_barcodes)
|
||||
letters = []
|
||||
for letter in input:
|
||||
x = get_tubes_for_letter(letter,
|
||||
len(letters) + 1,
|
||||
available_tubes,
|
||||
letter_dir)
|
||||
available_tubes = available_tubes[len(x):]
|
||||
letters += x
|
||||
|
||||
output = letter_tubes_to_obj(letters)
|
||||
with open(output_path, 'w') as file:
|
||||
json.dump(output, file)
|
||||
|
||||
|
||||
def letter_tubes_to_obj(x: [LetterTube]) -> dict:
|
||||
output = {}
|
||||
output["Items"] = [{"BarcodeValue": y.barcode} for y in x]
|
||||
output["TargetPositions"] = [{"PositionIndex": y.index,
|
||||
"GroupIndex": y.group}
|
||||
for y in x]
|
||||
|
||||
return output
|
||||
|
||||
|
||||
def get_tubes_for_letter(letter: str,
|
||||
letter_index: int,
|
||||
available_tubes: [Tube],
|
||||
letter_dir: str) -> [LetterTube]:
|
||||
positions = get_letter_positions(letter, letter_dir)
|
||||
|
||||
if len(positions) > len(available_tubes):
|
||||
raise Exception("Insufficient tubes to fill order")
|
||||
|
||||
pixels = []
|
||||
for i, position in enumerate(positions):
|
||||
pixel = LetterTube(available_tubes[i],
|
||||
position,
|
||||
letter_index)
|
||||
pixels.append(pixel)
|
||||
return pixels
|
||||
|
||||
|
||||
def read_available(p: str) -> [str]:
|
||||
with open(p, 'r') as file:
|
||||
return [x.strip() for x in file.readlines()]
|
||||
|
||||
|
||||
def validate_word(input: str, letter_dir: str) -> bool:
|
||||
letters_available = [x[0] for x in listdir(letter_dir)]
|
||||
has_required_letters = all([x in letters_available for x in input])
|
||||
|
||||
return has_required_letters
|
||||
|
||||
|
||||
def get_letter_positions(letter: str, letter_dir: str) -> [int]:
|
||||
filename = [f for f in listdir(letter_dir) if f[0] == letter][0]
|
||||
with open(path.join(letter_dir, filename), 'r') as file:
|
||||
return [int(x.strip()) for x in file.readlines()]
|
||||
|
||||
|
||||
if __name__ == "__main__":
|
||||
main()
|
||||
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